Pró-Reitoria de Graduação - IG
Pró-Reitor: Prof. Celso Massaki Hirata
Esta Pró-Reitoria é constituída por duas Divisões: a Divisão de Assuntos Estudantis (IG-DAE) e a Divisão de Registros e Controle Acadêmico (IG-RCA). Vinculado à DAE, está o Centro Acadêmico Santos Dumont (CASD), órgão representativo dos alunos de graduação. A Pró-Reitoria é assessorada pelo seu Conselho (CGR), composto pelos Coordenadores de Cursos de Graduação, um representante dos Programas de Formação Complementar (PFC) e os Chefes das Divisões anteriores.
Pró-Reitoria de Pós-Graduação - IP
Pró-Reitor: Prof. André Valdetaro Gomes Cavalieri
A Pró-Reitoria de Pós-Graduação (IP) é constituída de duas Divisões: Divisão de Pós-Graduação e Pesquisa (IP-PG), responsável pelos cursos de pós-graduação "stricto sensu" nos níveis de Doutorado, Mestrado e Mestrado Profissional e a Divisão de Educação Continuada (IP-EC), responsável pelos cursos de pós-graduação lato sensu (MBA, Especialização, Aperfeiçoamento), de extensão. A Pró-Reitoria de Pós-Graduação é assessorada pelo Conselho da Pós-Graduação e Pesquisa (CPG).
Pró-Reitoria de Pesquisa e Relacionamento Institucional - IPR
Pró-Reitor: Prof. Mauricio Vicente Donadon
Esta Pró-Reitoria é constituída de duas Divisões: a Divisão de Relacionamento Institucional (IPR-RI), a quem compete a supervisão e coordenação dos programas de cooperação com entidades externas ao ITA e a Divisão de Projetos de Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação (IPR-PDI), responsável, basicamente, pela supervisão e controle dos projetos de pesquisa com empresas, órgãos de fomento, entre outros.
Pró-Reitoria de Administração - IA
Pró-Reitor: Cel Int Vivian Santos Gomes
A Pró-Reitoria de Administração deve garantir o apoio administrativo, logístico e operacional aos demais setores
do ITA, além de planejar, dirigir, coordenar e controlar as atividades de administração de pessoal civil e militar.